根据计划内容，原本的星耀宇航团，由于无法适应修改过后的宇宙舰队编制。所以进行了算的上全面的修改，修改过后的星耀宇航团暂定更名为“星耀宇宙舰队司令部”。
原本杂七杂八的宇航团，众多岗位也进行了详细的分类。具体细化的分工，也方便军官，士兵明确自己的工作内容。而不是像现在这样，缺什么了就安排人去学什么。完了就上岗，这样是效率低下而且繁琐的。
舰队司令部设置总si令一位，根据条例规定总si令一职由现在的星耀以后的国家，最高长官担任。目前这个职位由“凌天”挂名。总si令有发动战争，任命高级军官，授权大威力武器开火等一切命令的权利。
下设军事副总，主管具体战役，战术制定，分析，指挥，调度。具体来说就是这人就是军队的主要军事主官。总管一切战斗内容，目前任命人选刘福建！
下设军务副总，主管情报分析，敌情收集，资源储备，资源调配，人员协调等一切军务后勤。目前有龙立担任！
两位副总没有上下之分，属同级，分管内容不同。
舰队司令部下设，勤务局，情报局，翻译局，通信局，星图局，工程局，数据局，战机兵团，机甲兵团等等十七个，各种宇宙舰队需要用到的部门。涵盖了目前星耀需要的方方面面，也同样的对每个局的工作内容做了详细的解释和功能划分。
另外按照计划报告中的划分，一艘战舰无论大小。从上到下大致分为舰长，总揽全舰所有人事物，理论上他可以管整艘舰所有岗位以及舰员。但是一般情况下只负责战略上的内容，只下达相对重要的命令，多数时候只需要监管其他下级工作就好了。
接下来是大副，全称（战舰第一副舰长）也就是舰队的次一级主官。负责舰队的日常操作，包括但不限于调整航向，设定目的地，舰员日常，舰员调度，调解矛盾总的角色是舰队管家。
二副，全称（舰队第二副舰长）战舰第三号人物。负责战舰总后勤，包括但不限于物资储备，物资调度，能量分配，协调供需总的来说就是负责战舰一切资源。
安全官，全称（战舰内部安保队长）。根据所在战舰的大小，带领相对应的警戒人员。队员从战舰内部募集，紧急请况时用以维持舰队的整体稳定，并在战舰遭受敌方登陆入侵是作为内卫人员组织抵抗。功能仅限于舰内，不参与行星登陆作战，无警戒任务时队员继续从事之前工作。
舵手，全称（星舰驾驶员）负责根据舰长的指示，按照指示操作战舰按要求航行。必要时大副可亲自接管…
首席工程师，这是一个负责处理维护舰队紧急事故的团队。由首席工程师带领，成员根据战舰大小而定。需要精通战舰每个组成细节，可以在战舰受损的第一时间修复。以防止创伤扩大影响战舰发挥………
首席科学官，战舰的科学研究团队，处理并初步分析战舰探索的新发现。这个职位一般不出现在，战斗舰以及小型舰只上。
通信官，负责战舰和舰队的沟通，以及和si令部的沟通。甚至可能的外星文明沟通，大多数时候传递舰长命令。