“神奇宝贝联盟是真正热爱神奇宝贝的人们互相切磋战斗的地方。圣火，火焰鸟的火焰在守护着我们，各位神奇宝贝训练家，请光明正大，做出绝不留遗憾的战斗吧！”
本届的关东联盟终于开赛了，为了能将mega进化更好的融入到当今的联盟比赛中，联盟的高层经过多次商讨最终决定废除原有的赛制，新赛制采取积分制，具体的规则如下－
首先第一部分－擂台赛
两边选手事先决定好要出场的三只神奇宝贝，并不要求出场顺序，两边训练家可根据场上的变化自行决定要出场的神奇宝贝，但只能是事先决定好的三只中的一只，不可以使用携带的其他神奇宝贝，胜利者可获得三分。
第二部分－团队赛
两边各自派出两只神奇宝贝进行团队赛，不允许更换神奇宝贝，当其中一方两只神奇宝贝全都失去战斗能力比赛结束，胜利者可获两分。
第三部分－个人赛
两边各自派出一只神奇宝贝进行一对一的对决，胜利者可获得两分。
积分规则
第一部分附加分规则：
擂台赛：擂台赛的胜利者除去原本可获得的三分之外，还可额外获得附加积分，积分规则为，如胜方场上剩余神奇宝贝数量大于一则可根据剩余神奇宝贝的数量进行加分。如剩余两只则加两分，剩余三只加三分，剩余一只不加分。
团队赛：团队赛的胜利者除去原本可获得的两分之外，同样也还可以获得额外的附加积分。如两只全部在场则加两分，如只有一只在场则不加分。