弘治五年（1492年），邵清乡试中举，次年授官江西德化（今江西省九江市）教谕。教谕虽然只是个很小的小官，却掌管县儒学生员的教诲之责。邵清不以职卑为轻，任教谕九载，“俸入之外，一钱不取；诲生徒，暑寒罔间，力变习俗。”确实是以身作则，为人师表。弘治十七年（1497年），他部试第一，授官监察御史。以教职而授监察御史，此前尚无先例。
邵清起初受命督办卢沟桥抽分（征收），他“痛革宿弊，奸无所容”。到正德初年他又受命巡办长芦盐政，兼理河道。他核实余盐，革除弊政，抚恤灶丁，结果“势豪盐商，凛凛重足立，贪吏多弃印绶去”。
邵清办事清正刚直，论劾处置的多为权贵，又不肯稍有姑息，即使有人请托都御史出面讲情，他也不肯买账。邵清因此得罪了不少权贵富豪，为他们所嫉恨，不久便因宦官和富商合谋诬陷，被置于午门下用刑。家里人来看他，不由失声落泪。邵清却坦然受刑，并劝慰家人道：“我非自败名节，以辱先人至此，况得失在我，何哭为！”此后邵清被免职家居，他也乐得闭门谢客，每日在园中种菜，在书房教子，过着清贫的生活。
嘉靖初年（1522年），邵清再次被起用为云南按察司佥事，但他依然不改当日的清直之风。初至任，便为属官辩诬，又巡视诸寨，修城垣，召商贾，办了不少利民之事。
滇南一带，素以出珍奇闻名，邵清却一毫不取，所入只是分内的廪禄柴薪而已。等到入京办事时，随身携带除了行李图书，此外一无长物。邵清自己清正，对属下也约束极严，史书中称他：“下至胥吏舆台，一无所染。”深为当地少数民族所悦服。
邵清晚年辞官家居，回到南京，就连自己居住的地方也没有，只好借住在岳父家中。他一生为官清正，家无余赀，以致贫困到连吃饭都困难了，常常到了中午，家里还没能举火烧饭。可是邵清却毫无怨言，依然过得十分自在。
有一天，督学御史林有孚到邵清家中来拜访，两人谈得非常投机，可是始终对坐而谈，也不见家人备茶待客，原来邵清家中已贫得无茗具可设。林御史知道后感叹而去。
当时有人将朝廷没收的官田送给邵清，帮他借以养家，邵清却断然推辞，不肯收受。他就这样清贫地度过了晚年。
在他80岁那年，终于在贫困中病倒了。儿子守在他身边，邵清语重心长地对儿子说道：“为己谨独甚难，平生不敢受安逸，唯我与汝自知之。”又说：“兢兢业业，过了一生，将盖棺，务保全无过，瞑目时心始放下耳。”这便是他的遗言。几天后，邵清便与世长辞。
邵清是名实相符的清官，他为众人所敬重，为世人所效仿，是难得的好官。不少人一生不是为名就是为利，这二者的确很难分割。但一个追名逐利的人，并不能因此说明他品行不好，道德败坏，判断的依据主要还在于名实是否相符。
品德真正高尚的人，并不会去刻意追求外在的名利，他只是觉得所有的事情都是在自己的义务范围之内，都是自己应该做的，也只有这样的人才能够得到人们的认可，从而名扬千里。