1780年冬，武卫军完成了江南的平叛任务，开拔返回北方。从组建至今的武卫军，也算是战功赫赫，连战连捷，按理讲应该被朝廷倚仗重用，但由于武卫军中军官大部分为唐人，而且从兵饷和后勤等诸多方面都受唐人的节制，所以清廷无法对武卫军真正信任起来。甚至，对于武卫军的北归，朝廷都有些不太情愿的。
唐军进行换防，之前京师事变中驻扎北方的唐军已经走得差不多了，现在除了南苑还有一个骑兵团、山海关和塘沽各有一个步兵团和一个机步团，已经没有什么更多的军力。反观清军这一年中，靠着军购和拿着唐人给他们的操典，已经编成了不少的部队。首当其冲的就是以福康安关外八旗为核心组建的禁卫军，员额三万人，装备清一色的大唐主流外贸武器，已经完全担负起了京师的防卫工作。
嘉庆甚至自觉，有了禁卫军在侧，就算是京津地区有唐军的一个混成旅，也足以应付了。稍稍可能有些麻烦的就是驻扎在塘沽的那一个大唐机步团，装甲车的厉害清军已经充分认识到了，乃至在军购的时候，清人首先提出的就是购买装甲车，但是大唐自然不会出售这种武器给他们。
除了近卫军之外，清廷还正在组建直隶新军六镇，由于原本直隶绿营被唐军一锅端，而且相当一部分人投靠了唐军，变成了后来的武卫军，所以直隶新军还要重新招募兵员。虽然新军不是完全的火器化军队，但是规模也不算少了，这让嘉庆也多少有了一些安全感。
而这个时候，三万武卫军北归，让嘉庆不知道是喜是忧。一方面武卫军名义上是归朝廷调遣的，而且从建立至今，朝廷的调遣武卫军都没有含糊过。但是武卫军同时又受唐人指派这一事实，像一根刺卡在清廷和嘉庆的喉咙中。
现在，凡是唐军有驻军的地区，都是朝廷优先组建新军的所在。江南闽浙五省新军十一镇，两广新军四镇，这就是十五万人的兵力，朝廷的旨意是，务必在嘉庆二年确凿练成。这些新军都是选拔原本绿营士兵，然后又招募了一部分民勇重新组成的。采用的是全新的编制，不过军官却还是以前那一拨，虽有唐军教官的帮助，但究竟能够新成什么样子，也是很值得怀疑的。
广东治权移交，唐军也相应开始抽调原本驻扎广东的兵力回国。原广东有唐军一万多人，大多是原本的婆罗洲卫戍军。这一群士兵家族大多在粤省，也有很多人的家室已经迁往大唐本土。所以陆军第五旅和第六旅按理讲在广东才算是驻扎本乡本土。即便清廷的广东巡抚来到广州后，第五旅和第六旅仍将会将散布在该省的各地，特别是移民潜力较大的嘉应、惠州、潮汕等地。另外第五旅还有一部分兵力驻扎于东南亚的海外领，配合外籍兵团作战。
武卫军离开江南所留下的防卫工作，由江南新军接手。不过，经过一年的紧张筹备，另一支由唐人出资和训练并担任军官的武毅军，也基本编制完成了。武毅军是从清国全国招募士兵组成的专业军队，兵员来自广西、四川、山西、河南、山东、江南等多个地区。甚至初时，由于地域不同乡音差距，很多士兵都无法畅通地进行交流。虽然这个年代也有官话，可是一般普通的农家子弟也根本用不上这东西。