研究经济生态及经济生态的分支经济生态和经济群落拥有一套系统的方法，具体归纳起来可分为：正反推理法、假设法、综合生态因素影响力法和生态（种群或群落）之外因素分析法。
所谓正反推理法，就是要将现实经济社会活动产生的后果加以推理得出未来可能的结果，进而倒推回经济发展各个环节具体采取如何应对的策略。现实的经济社会活动既包括参与经济生活的因子大规模或具有代表性对整个生态或种群（群落）有较大影响的经济活动，又包括政策制定者为了达到一定目标对经济领域制定相关政策和法规的行为。在发达国家，政府在制定相关政策的时候，往往有许多智囊和公司为该政策进行评估推演，更有相关利益集团预估政策对本集团利益的影响，所以每每政策出台时总会讨价还价，甚至出台后组织抗议表示不满，表面上感觉通过某项法案的时候阻力很大，但是，这样讨论下来的结果往往可以使政策的副作用达到最小。而一些较为集权的国家，由于通过任何法令没有其他声音，似乎效率很高，执行以后往往弊病很多，甚至激化民间矛盾。前者就是对客观规律的尊重，也是对笔者研究经济生态意义别样诠释和客观应用。如果全社会特别是决策者能够注重经济生态的研究，多方位多角度运用生态研究方法正反推理法，推演任何一项政策实施后的正负作用，客观评估和运用执行政策。经济生活的普通参与者运用正反推理法可以推断出某个行业或子行业的未来走势，得出正确的走势可以反过来指导参与者具体的经济行为。
这里可以以中国房地产行业的投资和政策制定来举例，现在的中国房地产围绕未来一年后是涨是跌，挺房派和倒房派各抒己见，均有自认为可以决定房地产未来走势的因素支持各自对未来走势的所谓权威判断。挺房派主要从政府特别是各地政府和银行融资平台的角度从所谓经济规律的角度曲解未来的走势。倒房派则是从房地产行业存在巨大的泡沫和老百姓收入无法支持高房价的角度客观劝说大众认同自己倒房的观点，但是，面对既得利益集团坚决挺房不让利和各地政府惧怕房地产下跌暗中支持的局面，单纯地劝说难于抵挡过去购房盈利事实的“诱惑”，所以不被民众广泛接受。至于房地产未来究竟如何演绎，倾听笔者详细推演。
房地产未来走势其实只有两种：要么下跌，要么上涨，没有折中方案。所谓的稳定上涨在现阶段现有房地产政策法规下很难实现，正值世界经济危机的背景下，房地产的高位运行更是一种天方夜谭。如果未来一年或几年房地产继续上涨，银行的账面保持盈利，各地政府仍然可以把土地高价出售给开发商，开发商依据升值的房地产可以获得更多的贷款，房地产继续高位运作，老百姓面对畸形的房价越来越难于出手，如果中央政府增加货币供应可以在以上步骤持续运作，但是接下来的问题会接二连三的出现，第一就是其他行业的萎缩，工业制造业会在高房价运作下持续萎缩，零售业和服务行业也会因为难于承受高房租和萎缩的营业额出现大量倒闭，政府如果希望前面维持银行和地方融资平台而不断挺房的话，伴随着大局印钞的副作用就是经济出现恶性通货膨胀，由于通货膨胀和房租蚕食利润，大量第三产业的店铺出现倒闭，工业制造业的投资者因为日益减少的行业利润逐步转投房地产及相关行业，整个社会除了房地产行业别无其他。而政府在为房地产和银行买单的同时也不可能对生态系统其他行业同时巨额贴补，面对百业荒废的局面除了无奈更无它法。第二对于银行系统，伴随着老百姓收入的锐减和大量富人从巨大泡沫的房地产里抽逃资金，银行的不良贷款率出现急速上升，最终迫使银行系统的破产风潮大量出现，滞留在国内的财富迅速化为乌有。地方融资平台也因为政府和银行系统的不利运作变得越来越难以融资，地方银行相继破产，融资平台形同虚设，政府穷得连职员的工资也难以兑现，更别说其他项目进行了。对于老百姓，一方面是收入的锐减，房地产以外的其他行业运作形势恶化导致就业形势的恶化，个体小经济入不敷出，节俭成为未来主要的话题，另一方面是高房价带来的恶性通货膨胀，维持不动产的费用逐年增长，房地产消费蚕食着人们的口袋，压缩着人们日常消费，最终人们为了活命保住一日三餐被动选择放弃所谓刚需买房，或者成为未来拖欠银行房贷的一员。房地产上涨经历一次悬崖式下跌，所要投资房地产的投机客全部被套，房地产价格在经济规律纠正过程中选择具有杀伤力的下跌，其跌幅之深可能难于想象。
历史上的中国，总有许多没有按客观规律办事的例子，因为没有正确的解读就没有对规律正确的认知，很多国内的经济学者把参与经济生活的政府这个因子作为经济生活决定因素，奉行政府指哪儿经济火哪里，让政府背负了比其他经济体更多的责任，在经济转型和深化改革的时候很难做好自我定位。
让我们对房地产经济进行反方向推理，政府对房地产行业进行打压，具体就是增加房地产物业税（也可以叫房产税）和房产增值税。具体就是说，按个人拥有房地产的数量征税，多占多征，无论任何产权有无房本，按房地产实际建筑面积征房产税。房产增值税则是按照住户购买房地产价格和现在价格的差价按百分比征用。两税并发，房地产拥有者即房东会因成本上升，考虑出手多于房产，房地产价格随之应声下跌。这是支持房地产上涨的各地政府因为税收的增加不会有很大的影响，相反，一部分银行会出现巨额呆坏账濒临倒闭。但是相对于前一种情况最终导致银行业大量倒闭的情况，这种情况导致部分银行的倒闭是可控的，而且除了部分富人在这些银行存款消失，大部分居民银行存款政府可参照国际通行做法给予本金的保障，基本不会影响社会的安定团结，相反会让中国老百姓认识到银行存款真实性质，同时客观上可以刺激国内消费、消化过剩的产品库存，同时可以消灭银行内灰色存款。随着房地产价格的下跌，流入房地产的投资资金从新分配到其他行业，客观上促进工业制造业的再次繁荣，零售业和服务行业因为房租的下跌从新繁荣起来，同时老百姓平时的生活成本也随着下降，老百姓拥有更多的钱用于平时消费，也通过物价下跌节省下来的资金可以在房地产下跌过程中逐步消化来自房地产投资客的房产抛单，最终将高位下跌的房地产止跌于一定的较低价位。国内需求也因老百姓家庭出现结余缓慢上升，加之国家应为部分银行倒闭消化呆坏账加印一定数量货币，促进社会良性通货膨胀，客观促进经济平稳增长，笔者认为，这才是房地产政策制定者应该实行的具体政策。
针对普通投资者而言，投资者不能把每一次投资作为赌注压在政策制定者身上，更不可能在房地产投机短期市场上博取利益，只能根据现在投资品种的状况决定未来的投资，根据西方投资理论，我国的房地产已经出现了严重的泡沫，无论上面那种推演，房地产走势已经不可能重复以前几年的走势，下跌只是时间问题。其实，不管它是什么商品，只要它失去了本来的用途，即马克思政治经济学理论中提到的使用价值，这种商品未来的命运已经堪忧了。次贷危机，美国穷人本来是买不起房子的，可是经过次贷提供者银行的运作，空手套白狼的房产居然成为穷人生财的工具，穷人各个账户实现盈余。今天的中国人同样依靠房地产做着自己构想的发财梦，而中国的无房穷人越来越无法负担现在跃跃欲涨的高房价，更有一部分房奴未来即将向银行赖账。对于这样摆在面前的现实，普通投资客还有兴趣拿巨资投入房地产吗？其实，保值增值的品种很多，为什么我们只钟情于房地产呢？不要等到房地产下跌释放出对财富巨大的绞杀力展现的时候，我们才想去撤离房地产投资，到时候只有空荡荡掉价的房产和自己缩水的账面财富。当绞肉机开动的时候从末端流出的碎肉还能还原本来面目吗？答案是否定的。
假设法是指在分析生态经济过程中，假设未来某一现象或某一影响经济生态的经济事件出现，就此作为基础推理接下来的发展结果。假设法是为了丰富推理法的内容，因为任何经济结果发生的时候，经济参与者都会采取积极应对的方式处理自己所能处理的事情，尤其是国家政策的制定者，必定会采取相应的措施，制定一定的政策，包括救市、注入资金等财政政策。笔者提到的假设的事件就是这些具有普遍影响力的事件。首先假定其发生，然后推导出经济生态接下来会产生的效果，整个生态发生正面和负面的效应。当然假设法的假设不能随便设定，更不能设定当前不可能出现的情况或者是概率极小的状况，但是可以设定一些极端政策用以警示政策制定者不要盲目运用自己的权利给经济运行带来不法挽回的后果，也可以用来规劝对自己失误投资心存幻想的投资客及早止损。当然，荒诞无稽的假设例如世界末日等最好不要出现在经济生态的分析过程当中。下面就假设法列举说明一下：
以房地产行业为例，假设未来国家采取放任房地产或者鼓励房地产上涨的政策，房地产进一步通过银行和地方融资平台绑架中国经济，房地产的价格被投机客从银行借来的资金疯狂最后一把，大量的现房聚集到投机客的手中，经济生态中除了房地产行业均出现萎缩，许多中小私营业主因为无法承受高额的房租被迫关门，存在的零售业和服务行业被迫提高单价，造成社会恶性通货膨胀。由于最能消化就业的零售业和服务行业大量关门，社会中真实的失业人数急剧上升，平民百姓入不敷出，被迫选择节俭度日，零售业和服务行业雪上加霜，再次提高单价应付成本，形成恶性循环。直到商铺存量中出现大比例空置现象，可能在中国达到50%以上，房租不得不下降，导致投机客对房地产的投机失去兴趣。投机客开始抛出自己手上的房源，可惜房价太高无人问津，于是，更多的投机客后悔自己的投机行为，大量抛出房源，房价一落千丈，于是，地方债务平台变成一堆烂帐无法运营，银行呆坏账急剧上升，最终达到大面积破产的边缘。国家开始实施紧急措施，经济回到半计划半经济时代，老百姓生活回到二十年前。这是主导经济的参与者最不明智的一种经济引导方式，既得利益集团为了自己的一己私利毁掉了二十年来改革开放的成果，虽是罪人却掏空国家远赴海外过着奢华的生活，经济硬着陆以后，一切从零开始在经过国人艰苦奋斗和虚心学习外国经营经济的经验，中国还可以再次崛起，崛起时，中国的各行各业素质大幅提高，学历较高（泛指接受过正规教育的本科以上）的人才充斥到政治、经济、文化教育等部门的关键岗位，社会上尊重人才尊重知识的风气成为主流。
同样假设政府采取坚决打压房地产的政策，具体推演如前面所讲的一样，政府可以在部分银行破产的时候绞杀一部分富人的财富，一部分潜藏的灰色财富，同时保障居民合理的存款，这样以来，可以有效防止财富外流，降低老百姓日常生活成本，促进居民日常刚性消费，最终促进国内需求，保住一部分行业的合理利润，保住私营中小企业的生存，在经济危机的背景下保住最合理的就业，有效遏制经济危机的扩大和蔓延。
综合生态因素影响力法就是在分析研究经济生态系统中各个因子的时候，要分清主次，分析影响和决定未来行业走向的因素的时候要综合各种因素的影响力，叠加在一起，最后确定未来的方向。例如：在房地产行业判断未来的走势，我们需要考虑很多因素，首先要考虑老百姓收入和房产价格的关系，笔者认为这是一个影响甚至决定房地产未来走势的关键因素。因为它的计算可以直接推导出未来存在于房地产市场上的刚需究竟有多少。一直以来，房地产行业的刚需就是业内争论的关键问题，所谓刚需就是刚性需求，挺房派认为它的购买量不会受任何因素的影响和动摇。但是刚性需求作为一种需求，他必须符合需求的两个关键因素，第一是有购买的需要，马克思政治经济学上说就是迫切需要其所谓的使用价值，第二是要有购买的能力，确实能够负担起这样的价格，俗话说，一分钱难倒英雄汉，在当今人与人之间信誉较低的情况下，缺钱变得很无奈，银行贷款也要还利息的，挺房派不要动不动就说借点钱就可以了，不行你们成立基金帮助这样的穷人吧，最好无息贷款。即使贷到款还款也成问题，希望挺房派多多体察民情，周全分析未来房地产市场走势。