经济生态的研究，必然涉及到对于经济生态的干预。经济生态的干预种类繁多，但是大多离不了通过改变经济生态环境及经济生态组成个体来干预经济的手段。对于各级经济生态的干预可以分为两类，一是针对该经济生态存在环境发生的改变；二是针对经济生态内部因子发生的干预。
针对经济生态所处环境的改变主要体现在区域经济生态的官方采取何种政策应对外部经济环境，例如：中国80年代的改革开放，2000年以后加入世贸组织，这些干预通过对于自身经济体所处的经济环境的改变直接改变了经济体内所有个体及各层经济生态的环境，导致经济体内所有个体随之发生改变。在当今的世界经济生态里，各国都在上演着激烈的合纵连横的经济外交，这些与经济有关的政策、外交都可以算作通过改变经济生态所处环境的手段来实现改变经济生态的目的。
针对经济生态内部因子发生的干预可以按照改变激烈程度分为改变经济生态内部个体构成的形式、调整经济生态内部结构和提高经济生态构成质量三种形式。第一种形式对于经济生态内部改变比较激烈，往往通过引入大量的个体或组织等形式改变自身内部的构成，由于新成员大量加入必然推动内部运行规则的改变，通过此法可以较为彻底地改变现阶段各项运行制度，起到脱胎换骨的境界。但是，这样的干预可以预见到的未来的成绩和所要承担的风险相对等，具体处理的时候需要多方位论证，消除其中不利于开展工作的因素。早在明治维新的时候日本就利用类似的方式让日本国从幕府时代的旧制一下子跃升到了西方列强的新型制度。当时的日本社会通过全盘西化的政策让本国的现代化工业体系迅速成长，加速西方文化对于本国的渗透，最终在短时间内与西方列强平起平坐，成为这一干预方式下最为成功的案例。笔者在自己的作品《用《经济生态学》理论解决实际问题》里第一篇 经济生态理论如何让中国足球腾飞 提到的方法也是依据这个原理来解决实际问题的。
第二种方式则是通过经济生态体系内部的权与利及其对等的义务等内容的调整，实现经济生态和谐健康地发展。西方大多数发达国家就是通过这样的方式实现现在文明的。期间也有许多时候出现很激烈的对抗，由于没有现成的发展模式，所以处于社会各个阶层的经济个体从一开始不遗余力的斗争发展到最后学会互相让步寻找和谐共赢的平衡点，最终形成了稳定完善的经济体制。但是这样的调整方式不是所有国家都能达到完美效果的，很多发展中国家由于掌握政权的既得利益集团出于对自身利益过度的保护，不忍心将既得利益让出妥协，在经济生态内部发生调整的时候，总要利用自己掌握的资源殊死搏斗，最后导致政治生态反复变化，拖累经济生态的常态发展，甚至导致经济倒退。有些在改革过程中绕着既得利益集团的利益走，进行一段时间以后经济生态便遇到阻力停滞不前，出现倒退甚至激化矛盾导致政权更迭。原沙皇俄国就是这样的事例。
第三种干预方式最为平和，但是最基本。这样的干预方式在成功的区域经济生态中通常作为一项长期的辅助措施伴随在主要干预政策出现，主要作为巩固干预成果的一项长期有效的措施。但是在中国相对保守的思想作用之下，往往作为一项掩人耳目的改革策略反复吹嘘，最终起到自欺欺人的恶劣效果。例如历史上的满清政府就是通过这样干预方式来安抚爱国的亲洋势力，派一些留洋学生、购几只外国军舰、办几所西式学堂，做一些表面工作掩人耳目，妄图延长自己苟延残喘的王朝寿命。结果让中国眼巴巴地看着别国崛起，痛失自身宝贵的发展机遇。当然，虽然措施很假，但是也为日后推翻满清政府培育了许多有识之士，成为直接导致满清垮台的生力军。
尽管如此，这种干预方式往往作为一种主要干预的附属品存在，忽视它的作用也是很不科学的。干预经济生态的目的为了改变经济生态运行轨迹，达到自己所需要的结果。但是，要想达到自己的初衷并巩固取得的成就，必须花很多经历和