当然，能够收服准格尔，做到真正的统一，版图之内，尽皆臣服，是胤祯足以继位的一大资格。即使武功上差一点，可是领兵出塞有三五年之久，这番辛劳是其他皇子所不曾经过的，光凭这一点，选取他继承大统，亦可使他的同胞手足，无话可说。
因此，这一年的三月间，皇帝命平逆将军延信、副都统吴纳哈，领兵进驻西藏。五月间命胤祯驻兵甘州，渐次部署远征准格尔。谁想到到了康熙六十年，中原出了两件很荒唐的谋反大案。
第一件是在山东，有个盐枭叫王美公，聚众作乱，自封为‘大将军’。这场变乱，形同儿戏，很快地为官兵扑灭了。
另一处比较严重，发生在台湾南部，有个叫朱一贵的，是洪门天地会的首脑之一。平日以养鸭为生，生性任侠好客，很有些前明志士、山泽英豪、奇僧侠客，出入其门，酒酣谈兵，意兴极豪。
其时承平日久，吏治日坏。知府王珍是个贪官，苛征暴敛，民怨沸腾。康熙五十九年冬天，格外寒冷，兼以地震，失业人多，谣言四起，于是起事的机会成熟了。
朱一贵在四月十九正式竖旗，先占冈山，后攻凤山，连破清兵，五月初一占领台南府城，知府以下的文武官员，纷纷上船逃回福建。总兵欧阳凯阵亡，更使得局势急转直下，诸罗县城亦为北路军所占领了。
到得五月初四，朱一贵称王建号，但民间却送了他一个‘鸭母帝’的称号。下置国师、太师、将军、都督、尚书内阁科部、巡街御史等官职。‘新贵’仍拿戏班子里的行头穿在身上，招摇过市，后面跟着一班顽童，拍手嘻笑，了无尊严可言。
这一场叛乱在六月间也给官军平定了下去。但处置善后事宜，却颇费周折，直到年底，方始大定。于是康熙六十一年开始，皇帝全}文手打}}又专注在征准噶尔一事上了。在正式动手之前，皇帝做了一桩看起来很普通，事后证明很错的任命，他让年羹尧兼理陕西的军务，官称由“四川总督”改为“四川陕西总督”。
到了这一年的十月，皇帝圣躬不豫，而且来势很急，康熙自知不起，做了下面的安排：一件是批阅奏章，命皇三子诚亲王胤祉替代；一件是致祭孝东陵，特派皇五子恒亲王胤祺前往；还有一件事是冬至南郊大典，他命皇四子雍亲王胤禛恭代。
冬至大祭非常隆重，照例是要斋戒的，住在斋所要好几天不能自由行动。当此紧要关头，忽然有这样一个差使，胤禛大为焦急，只好假意上奏，说圣躬达和，恳求侍奉左右。皇帝自然不许，在原奏上批示：‘郊祀上帝，朕躬不能亲任，特命尔恭代斋戒大典，必须诚敬严恪，尔为朕虔诚展祀可也。’
除此以外，皇帝又派御前侍卫阿达色，连夜驰往西北军前，立召大将军胤祯回京。显然的，皇帝是怕自己一病不起，所以召回胤祯，以备继位。康熙的设计可称圆满，遗憾的是，他的盘算全然落到了空处。
雍正夺位的手段深刻已极以致一旦隆科多口衔天命宣读遗诏，多智如八阿哥胤禩者，竟无法做出任何反应等到心里上能够接受‘皇位竟然落入四阿哥之手’这一事实时，已经错失了最宝贵的，可以提出异议的时机
雍正到底是顺位还是篡位，史家争论不休，本文不过是截取其中一方的观点加以阐述，读者不必认真。
登基之后，雍正把时间放缓了两年，这两年之中，他把全副精力用来对付各种潜在的政敌，如胤祯，胤禩，胤禟等人，待到处理得差不多了，这才准备继承先皇遗志，对青海动手——这时候，那个野心不死的罗卜藏丹增已经势力愈加庞大，在青海蠢蠢欲动——在他想来，总要做出一番可以夸耀于人的武功来，好让天下人知道，自己的帝位并不是篡改遗诏得来。
于是派年羹尧为大将军，全权处理对青海反叛部落征剿战事。
雍正皇帝对年羹尧的处处恩结，时时笼络，不但已经出了格，而且让人觉得肉麻，年羹尧陛见回任，皇帝立刻派人颁赏，除了貂帽，蟒袍，御笔的‘福’字、春联、鼻烟，安息香之外，还有一件四团龙貂皮褂——这最后一件衣服，是御用之物。
年羹尧在谢恩折子中陈奏明白，请求皇帝收回这一件赏赐，不久之后有朱批发回：“只管用当年圣祖皇帝有例的。”
除了这些，从正月开始，赏赐更加不断，诸如荷包，玉环，人参，鹿尾，野鸡，橙柚，奶饼等食物；西洋圆规，茶叶，东珠等物事更是不一而足，总之每过十天半月，总会有赏赐传到军前。至于朱谕中的亲热之情，更加是旷古绝今。