众诸侯各回本部后，果然没多久就开始互相征伐，董卓听得消息也是喜笑颜开，心道让你们争去吧，只要天子在我手中，我就可以挟天子以令不臣，后来孙坚也落得惨死，从此以后董卓自认高枕无忧，他自称为“尚父”，出入皆僭越使用天子的仪仗，又封其弟董旻为左将军、鄠侯，侄董璜为侍中总领禁军，董氏宗族不问长幼皆封列侯。眼见诸侯散去，天子每日煎熬，百姓生不如死，朝中司徒王允也是看在眼里，痛在心上，这一日他看见歌伎貂蝉再牡丹亭畔长吁短叹，便上前询问，没想到貂蝉却是和自己一般心思，于是王允计上心来，他收貂蝉做义女，又请来吕布赴宴，席间吕布也正巧见到貂蝉，王允见吕布双眼盯着貂蝉，心知此计成了，便开口说仰慕吕布的勇武，愿把小女貂蝉送于吕布为妾，吕布自然点头答应，高高兴兴的就走了，只等良辰吉日。
又几日，王允见吕布不在身旁便请了董卓入府，又使貂蝉在董卓面前献舞，董卓见貂蝉生的美丽，唱歌做舞又是好手，不禁问王允“此乃何人？”王允见董卓动了心思，便回“此乃歌伎貂蝉，年芳二八，愿献于太师。”董卓听了此言也是大喜，便收了貂蝉回府，吕布闻听消息便去找到王允，王允推说是董卓知道貂蝉许了吕布，特意带了回去，准备良辰吉日嫁于吕布，吕布又去找了貂蝉，貂蝉却说是董卓强行纳了自己，从此董卓与义子吕布两生嫌隙。李儒知晓此事后，便劝董卓把貂蝉送于吕布，貂蝉却对董卓说“本以为太师是个英雄，没想到却要听小人之言把自己送于吕布。”说完便要寻死，董卓见此，从此与吕布关系更恶，王允知此计将成，便找上吕布商议不如杀了董卓，吕布正犹豫间，王允又说“你和董卓又不是真父子，再说将军若能匡扶汉室，岂不青史留名，流芳百世！”
吕布本无良心，听了王允之言便下了决心诛杀董卓，二人找到李肃，让其引出董卓，果然董卓听闻有诏天子准备传位于自己，王司徒也搭好了受禅台，便令心腹李傕、郭汜、张济、樊稠带领三千飞熊军守住郿坞，自己回京受禅，董卓前呼后拥的向着长安而来，可先是折了车轮，又有狂风大起，紫雾遮天，幸好有李肃说这是吉兆，到了半夜又有小孩歌声随着风飘入了大营之中，“千里草，何青青！十日卜，不得生！”，李肃一听这千里草正是董字，这十日卜正是卓字，这歌声明显是说董卓快死了，这是何人教的谶歌？好在董卓年老，听的模糊，李肃又一次糊弄了过去。
第二日到了长安，董卓摆好仪仗准备入城，忽然他看见有个穿着青袍头戴白巾的道人手持长杆站于门边，那长杆上各绑着一块布，两边各写一个“口”字，董卓也没在意，却不知这上下有口便是吕字，写在布上，便是吕布，而董卓的卓也是上下两个口挂于白布之上，暗示着董卓将身首异处。果然董卓刚至北掖门，就被李肃割了头颅，董卓的谋士李儒也没有幸免被拉去市口斩首示众，百姓听闻恶贼董卓死了，莫不拍手称快，看尸军士更是拿董卓点了天灯，百姓见到董卓的尸身都用脚狠狠的踩踏，很多人又拿董卓的头颅当作球一般传来传去，以此泄愤。接着王允又命吕布同皇甫嵩、李肃领兵五万，至郿坞抄籍了董卓的家产。
董卓手下李傕、郭汜、张济、樊稠听闻董卓已死，吕布将至郿坞，也是连夜带着飞熊军向着凉州逃跑了。吕布到了郿坞先救了貂蝉出来，皇甫嵩则令人杀尽董家老小。李傕、郭汜、张济、樊稠逃至陕西，又使人向朝廷求赦，王允恨其四人是董卓的心腹，经常助纣为虐，所以没有同意赦免四人，四人得到消息后便想各奔东西，这时谋士贾诩说道“如今西凉已有马腾为主，天下诸侯皆知我等是董卓手下又如何容得下我们，等我们分散了兵力，到时候就是一个亭长也能把诸位抓了，诸位不如乘着手上还有一支飞熊军，杀入长安为董卓报仇。再说事若成了，我们就可以把持朝廷控制天下，若是不胜，再跑也不迟！”李傕等人听言觉得有理，便对士兵说王允不许我们投降，定要杀光诸位，诸兵士听完也是惶恐便聚兵十万，跟着几人杀回了长安，正巧途中又遇董卓女婿中郎将牛辅带着五千多人欲给董卓报仇，两军合兵一处，向着长安进发。
王允知贼军又杀回了长安，便让吕布率军前去迎战，吕布不愧无双猛将，先是败了牛辅，又杀的李傕退走五十里，李傕用计拖住吕布，又使张济、樊稠奇袭长安，吕布知晓贼人奇袭长安，便无心再战，急回长安，等他到时董卓余党李蒙、王方已偷开城门，四路贼军一齐拥入，吕布左冲右突拦挡不住，王允见大势已去，便舍身殉国，吕布也只能舍了家小，带着百余人投奔袁术去了。贼军占了长安后，李傕郭汜便想杀了皇帝刘协，张济、樊稠建议道“不如仍奉刘协为主，引众诸侯入关，再一一杀之，到时候天下就是我们的了。”于是几人仍奉刘协为帝，又开口向刘协讨要高官，刘协无奈，只能封李傕为车骑将军、池阳侯领司隶校尉假节钺；封郭汜为后将军、美阳侯假节钺，让其同秉朝政；封樊稠为右将军、万年侯；封张济为骠骑将军、平阳侯，领兵屯弘农；其余李蒙、王方等，各封为校尉。
李傕等人得了高官后又令人追寻董卓的尸首，最后找到了些零碎的皮骨，李傕又命人以香木雕成董卓报仇形体，以王爷下葬的规格，选择了一个良辰吉日，就准备把董卓遗骸葬于郿坞，结果天上下了大暴雨，水深都超过平地数尺，不知是不是董卓作孽太多，那天雷还向着他的遗骸就猛劈，也或许是木头引电所致，李傕等到晴天准备再葬董卓，结果又是下起了大雨，天空神雷也是再一次劈向了董卓，如此反复，最后董卓的尸身皆被雷火毁灭，李傕等人见状也只能作罢。不久西凉太守马腾、并州刺史韩遂二将引军十余万向着长安而来，原来他二人曾遣使去往长安，并与