刘峰在元和十一年调整了各大军区，北方的三个军区，新州、幽州和并州军区合并为两个。一个为东北军区，辖地为原新州和新占领的地方，该军区主要任务就是占据朝鲜半岛，然后灭掉夫余。东北军区司令为公孙姬苏，副司令为张水，化教员为汪齐。
原幽州军区和并州军区合并为北方军区，辖地为幽州和并州，其主要任务是防范北方鲜卑族，西面的羌族，其进攻目标是河套地区。在刘峰的计划，河套地区，务必尽快全部拿下。这是进军大漠的桥头堡，也是游牧民族进军原的必由之路。河套只有掌握在大汉民族的手，才能杜绝五胡乱华这样差点把汉族灭绝的凄惨事情生。
北方军区司令为马腾，副司令为马，化教员为原政务院办公厅厅长袁松。
原冀州军区、青州军区、兖州军区合并为央军区，辖地为冀州、青州和兖州，以及青州的海面，拥有关东系统唯一一支水军。这个军区的任务是保卫关东政府，保卫刘峰，建设青州港口和训练水师。
军区司令为王狗子，副司令为典韦，化教员为刘偕。
刘偕将军自从从军事学院毕业之后，被刘峰安排到总化部工作，政治思想工作做得不错，所以刘峰这次一下子把他提拔到央军区化教员的高位上。
在刘峰组建一支水师的时候，曾经伤透了脑筋，因为找不出合适的人担任水师司令。刘峰手下的大将大部分都是北方人，都是旱鸭子。只有一个很早就跟随刘峰的原刀盾兵都尉，后来的兖州军区副司令杨铁出身江南鱼米之乡，水性非常好，也善舟楫。所以刘峰让他出任水师司令，负责青岛港口的保卫和水师训练。
豫州和徐州合并为一个军区，叫做南方军区。辖地为豫州和徐州，以及扬州的寿春和庐江两郡。主要任务就是防范西面的袁术和南面的孙策，还要沿着长江建设港口，以便于将来水师停驻。
南方军区司令为吕布，副司令为赵云，化教育为吕四农。本来吕四农为徐州军区司令，但是既然要组建南方军区，那么徐州军区自然就不存在了。而且刘峰对吕布此人不太放心，安排了赵云做他的副手，又把绝对的自己人吕四农安排成化教员，监视吕布。
吕四农一开始还不愿意，本来他是一个武夫，也是靠着军功，跟随者刘峰一步步打上来的，自然不愿意成为职。不过刘峰做了他的思想工作，要求他帮自己看着吕布。说吕布此人乃猛虎，必须要有人时时监视提防他。吕四农这才勉强接受这个职位。