午夜12点半又发生了另一起火灾，接着又连续发生了另灾。情势已十分危急，因此，大家决定叫醒整夜一直在沉睡中的拿破伦皇帝陛下。据发现，城内所有的水管等灭火设施都被罗斯托普金离城前给毁坏掉了。但科兰古却成功地在克里姆林宫内找到了两条可用的水管，与此同时，仆役和士兵们搬运成桶的水及沙土来灭火；但火势太大，虽然军火库有大量的士兵保护，但宫殿的窗子已经开始纷纷碎裂脱落。“刚开始，拿破仑认为这场大火是由我们不守规矩的士兵疏忽大意造成的，”科兰古继续道，“他无法相信……俄国人会为了阻止我们占领这座城市而狠心放火焚烧自己的都城。”但是，被法军抓获的纵火犯很快就招认了是罗斯托普金下令焚烧城市的。“接着我又检查了帝国
，那里有一些欧洲的马匹及沙皇的御用马车。”科i“这场火灾使我们全军总动员——我应该这么说——这里的所有人都在全力救火。我们呼吸的不是空气而是烟火，我们的肺里充而满了烟尘。”在帝国卫队的帮助下，通往克里姆林宫南面的桥梁总算保住了。热浪席卷之处热得让人无法多待上一分钟，士兵们皮帽上的毛也由于过热而焦枯了
926日下午4点半，拿破伦最终下>+|的下一个目的地是位于通往圣彼得堡公路上离莫斯科仅数英里之遥的彼得罗夫斯柯耶宫。风助火势，火助风威，城西已经完全被烧毁了。拿破伦万分艰难地逃出莫斯科城，费尽周折总算于日落时分到达了郊外的安全地带。
在彼得罗夫斯柯耶宫，拿破伦显得很安静，怔在那儿出神。他原本打算留在莫斯科同沙皇进行和平谈判的，但是现在一切都清楚了：如果俄国人愿意与他进行谈判的话，那么他们就不会放火焚烧莫斯科城，就不会做出如此巨大的牺牲了。拿破伦决定缩短在此地的逗留时间，每件事都必须安排得井井有条，以便为最后的攻势做好准备。但是，这一决定在拿破伦听到缪拉带来的最新消息后就做了更改——该消息说：在审问了若干俄国官员及囚犯后，缪拉可以确定俄军已受到重创，士气十分低落，过不了多久沙皇就会被迫投降的——这一消息令拿破伦决定延长在莫斯科的逗留时间。
于是，9月28，拿破伦回到了克里姆林宫。在两天的时间内整个城市遭到浩劫，就连在火灾中扑救下来的房屋也遭到洗劫，斯洛博达宫——这座极其奢华的宫殿是拿破伦在克里姆林宫外为自己保留的住所——已在火灾中被夷为平地，而整个莫斯科城近3/4被付之一炬，这其中包括近800座教堂。法国军队不得不将刺刀对准自己过于放纵、趁火打劫的伙伴，并就地正法了一些人。
拿破伦十分肯定俄国人会投降并且送信到圣彼得堡要求和谈。拿破伦反复强调他所发动的这场战争是纯政治性的……并非为了个人的野心。而以最快的速度取得和平则是他的主要目的……因此，他不得不为了上述理由开战并打到了莫斯科，而这一切（发动战争）并非他所愿。
但沙皇坚决反对和谈，人们从没有见过亚历山大如此生气，如此坚决地拒绝一切有关投降的叛国性言论。拿破伦及其四处掠夺的法国入侵者们不得不打消和谈的念头，决心不计一切代价达到目的。“我和拿破仑的这场战争是你死我活的战争。”沙皇不计法军人数较俄军高出很多的优势，包括自柯尼斯堡以及格但斯克等法军军事要塞调来的约24人以及近6万人正在赶往东欧途中的新兵，就这样悍然宣布道。法军尽管人数占优势，但离法国本土上千英里，战线太长，联络不便、马匹和食物供给困难。况且严冬季节即将到来。拿破伦的以缪拉为首的强大的骑兵纵队已经被拖得七零八落，人数剧减，战马也不够，有些骑兵及高级官员们不得不从博罗迪诺步行到莫斯科。尽管沙皇手中军队数量不过仅有30万人，但他有强大剽悍的骑兵，他们对这块土地及气掌——俄国骑兵的斗志高昂，誓死保卫祖国。因此，沙皇亚历山大根本不愿意同法国谈判。
在回到克里姆林宫数天之后，拿破伦宣布他决定在莫斯科过冬。军队向城里搬进越冬需要的食物、皮毛、衣物等；防御工事有待加强，而有关从法国及波兰招募新兵的征兵令业已下达；另外，连接巴黎、埃尔福特、格但斯克、华沙以及莫斯科等地的通路也有待加强保障。尽管许多人都警告过拿破伦——他对俄国的冬天并不了解，但他对此却信心十足——他将给亚历山大一点颜色看看并将粉碎那些无聊的凶兆预言；而且，当亚历山大看到他如何信心十足地坚守莫斯科时，也许会就此屈服，正像拿破伦在战争之初就已那么设想的一般。
但拿破伦很快就发现他错了，沙皇亚历山大一次又一次的拒绝了拿破伦谈判的要求，并且进入10月后，俄国的天气突然发生变破伦开始考虑是不是该撤出莫斯科了。但这个时候已经晚了，灾难已经开始了。
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