谁也不比谁傻，在巴西独立人士的推动下，佩德罗拒绝了对方要求。不久后建立由若泽*博尼法西奥*德*安德拉达为首的新政府，更要求葡萄牙驻军撤出巴西。之后他以巴西的保护者自居，而作为报复，葡萄牙议会废除他巴西摄政王的头衔，并且正式向巴西派出讨伐军队。
当佩德罗知道彻底与葡萄牙议会闹翻之后，又听闻军队到来，便在圣保罗的伊皮兰加河边摘去了自己军服上葡萄牙徽章，同时拔剑高喊：“不独立，毋宁死！”
也不管这番举动是发自真心，还是政客表演，总之却赢得了巴西民众的支持。其后不久，巴西正是宣告独立，而佩德罗也把自己的名号变成了巴西皇帝佩德罗一世，若泽*博尼法西奥*德*安德拉达成了首相。
巴西从葡萄牙独立的过程，简单说就是儿子造了老子的反，老子却是默许的，双方演了一场戏，被玩的是葡萄牙议会。如果说之前的葡萄牙只是日渐衰落，帝国犹在的话，那么失去巴西，就已经不再是元气大伤可以形容，说难听点，葡萄牙从这一刻起，算是彻底退出了世界霸权舞台，完全失去了成为世界大国的资质。
当然，佩德罗也不过是个政客，虽然他促成了巴西独立，但同时他也是个独裁者。在未登基之前，他放宽了民众的权利，但当大权在握之后，他与绝大多数的皇帝并没有本质的区别，皇权天授，拒绝限制自己的权利，这样也为将来君主制的覆灭留下了伏笔。
虽然在葡萄牙国王若昂六世去世之后，作为长子佩德罗依然获得了继承葡萄牙王位的权利，但是葡萄牙国内无人将他看成是自己的国王，不得已他只得将自己的王位让给了自己的长女玛利亚，而弟弟米格尔摄政，不过这位摄政翻脸比翻书还快，不但篡位了，而且复辟。当哥哥的当然很气愤，甚至把巴西王位让给了自己儿子，然后在亚速尔群岛纠结了一帮人为自己女儿出气。米格尔终于还是无法改变历史的潮流，复古的传统君主制在法国发生七月革命的年代，根本不得人心。于是佩德罗取得了胜利，而他的女儿玛利亚又成了国王。说起来这位女王还是不错的，可惜34岁就一命呜呼。期间推行了许多善政，因此也被称为教育者，可是在这个动荡的时代，葡萄牙依然风雨飘摇。
又经历了几番王位变换，在布拉干萨王朝统治的后期，葡萄牙开始近代工业化进程，国内建立了主要铁路网，同西班牙以及欧洲大陆的其他国家相连接，对外贸易逐渐增加。同时在失去巴西之后，他们倒也没有自暴自弃，开始寻找新的殖民地，于是与其他欧洲列强一眼，开始将目标锁定在了非洲。
葡萄牙提出一个以“玫瑰色地图”著称的扩张计划，企图从安哥拉横越非洲到莫桑比克，进行殖民扩张，不过因此却触犯了英国的利益。英国发出最后通牒，要求葡萄牙人撤出希雷河流域，葡萄牙政府屈服，引起国内不满，共和主义运动不断高涨。闹到后来，葡萄牙还是有所收获，他们在非洲东西海岸还是获得了两块殖民地安哥拉和莫桑比克。
当王一派人找上门来准备用刚果河流域的殖民地，换取莫桑比克的时候，葡萄牙人误以为是肥猪拱门。本来他们就想要刚果河出海口，无奈法国和比利时反对，虽然有英国支持，可惜还是没能完成，这也是当初柏林会议召开的主要原因。而玫瑰色地图计划不过是之前刚果河的替代计划，与英国人产生矛盾，也是因为这个后续计划，不然他们还是同一个阵营的。
此时的葡萄牙人压根没把东北自治区放在眼里，虽然同意了计划，不过存心不良，同时他们也在大清盯着新的殖民地，而澳门不过是个开始。