末日星陨眼见大势已去，即刻化整为零，散作碎片分布在大星体的表面，由于力量过份微弱，短期之内已无法作恶，便决定等待力量恢复之后再卷土重来。收藏*顶点~小说~网
圣灵大帝则元气大耗，无望彻底清除星陨，惟有将幸存的部分人兽转移至小星体，再以残余力量形成灵力结界，抵抗星陨邪力的渗透。
元祖神兽因耗尽力量而灰飞烟灭，永远消失。
圣灵大帝失去挚友，悲痛不已。他向人类宣称：人类与神兽不分彼此，本是一体，以爱相互包容，方可创造崭新世界。
为纪念死去的元祖神兽，自此以其命名纪年，称为“元祖纪”。
圣灵大帝甚至在下界的陨落沙漠建造了巨大的元祖神兽石像，以纪念神兽救世的功劳。自从元祖神兽化为铠甲之后，圣灵界的人兽间亲密联系便恢复如初，每只神兽皆可化为兽铠协助主人。当兽铠威力以人类本身灵力相结合，便生出了另外一股强大无比的力量，被称为“兽元力”。
小星体悬浮于大陆上空，圣灵大帝将之命名为“大焚天界”，而下方遭到星陨邪力污染的大地则被称作“溟荒大陆”。
圣灵大帝指引人类与神兽努力重建家园，大量种植晶体植物，经过长时间的修复，大焚天界终于恢复了如同昔日圣灵界般的美丽。只是下界溟荒大陆的人兽遭受星陨残余力量的侵蚀，却不断生成邪恶的人类与恐怖的异兽，继续恶化着大陆的环境。
元祖纪378年，经过近四百年的衍变，在大陆之上形成了第一个不规范的种族——人族。他们外貌与大焚天界人类近似，不过大部分受到末日星陨能量感染，因而变得性情暴戾，以杀戮为乐。
圣灵大帝一心净化受污染的大陆，希望有朝一日能将邪恶消除，换回圣灵界永久的安宁，可惜由于当年与星陨的拼斗，元气大伤，已是无能为力。
元祖纪1805年，圣灵大帝感觉油尽灯枯，大限将至。临死之际，他使用最后的神力，创造出一枚可吸收宇宙中正极元素而不短释放生命能量的紫色晶体，名为“创世紫晶”（普兰迪与双子剑士所持的紫晶石就是其上碎片），作为圣灵界生命之源。再将自己化为无边灵力，融入了溟荒大陆，凭借自身的智慧及力量，抗衡复苏中的邪恶。
在圣灵大帝的努力下，星陨碎片的影响力被大大削弱，溟荒大陆产生了离奇的转变。
部份人兽得以清醒，恢复善良本性，他们试图在大陆之上建立属于自己的乐土；而剩余人兽则维持原状，更以侵略姿态仇视着善良的人兽。
圣灵大帝死后，留下十名后裔，合称为十大皇尊。
十大皇尊中最杰出的三位，圣灵女皇、智慧圣皇与溟破战皇成为了大焚天界的新一代统治者，被世人称作“焚界三皇”。
圣灵女皇负责大焚天界秩序的管理，威严而庄重，是为最高权威；智慧圣皇自创奇书《智慧典》，四处宣扬和平友爱的学说，深得人兽爱戴，成为圣灵界的精神领袖；而溟破战皇则因力量最为强大，担负起抵御外敌入侵，清除邪恶的职责，威望却是不及女皇与圣皇。
其间，智慧圣皇在圣灵界宣扬《智慧典》的高深理论，以“爱是永恒”为口号，引导人类及神兽不断进化，抵御末日邪能诱惑，重建大陆。此举得到圣灵界人兽们的强烈共鸣与支持，人们更以其名作为全新的纪年，称为“圣皇纪”。
元祖纪3000年终止，在圣灵女皇的宣布下，改为圣皇纪年。