就在杨震率部离开淮南根据地，向苏北疾进的几乎同一时间。因沿江日军封锁，渡江整整晚了半个月才渡江的军部以及主力。也在一月下旬日军沿江封锁缓解后，于苏南渡江。以强行军的速度向北转移。
于二月六日，在苏中部队的掩护之下，顺利抵达盐城新四军苏北指挥部，与杨震所率领的部队以及苏北部队汇合汇合。至二月六日，军部以及皖南部队主力抵达盐城，于一月一日正式开始的皖南部队北移行动宣告结束。
此次转移，皖南部队以伤亡、失踪一千余人，团以上干部牺牲五人的代价，顺利的突出了第三战区八个师重兵的合围和清剿，按照预定计划抵达苏北。虽然抵达苏北的时间比预定的时间整整拖延了大半个月，但不管怎么说，皖南部队主力和精华算是突出来了。
在军部与皖南部队主力抵达盐城的当天，为了与重庆宣布新四军为叛军的舆论相对抗。在皖南部队全部抵达盐城后，由原中原局与东南局组成的新的华东局，宣布重新调整新四军的编制。
新四军原有的支队编制撤销，各支队与南下的十八集团军部队几个纵队统一改编为六个师、一个旅。并按照各个师的活动区域，组建了一批二级军区。原淮南军区部队整编为二师兼淮南军区。
原本中央准备将皖江军分区单独划出来，组建皖江军区兼新四军第七师。但在杨震的建议之下，皖江军分区还是放在了淮南军区的建制之内，不过在兵力上得到了加强。由原老三团改编的淮南军区团，南下与无为游击纵队、三支队挺进团汇合。
而留在皖南坚持游击的部队，则改编为军分区皖南团，在建制上划归皖江军分区指挥。三支队挺进团也做好了准备，随时在必要的时候，渡江南下与一团汇合。至于皖南冲出来的老三团，则因为损失过大，暂时留在皖江地区休整、补充。
至于活动在苏中的一师，以及留在苏南坚持的第六师，相隔只不过一条长江的这两个师。杨震建议虽然对外编成两个师，但对内最好还是实行一元化指挥。以便苏中、苏南部队，在作战的时候可以相互的策应。
除了部队变化相当的大之外，整个新四军的统帅机关也做了一定的改变。军长与苏北总指挥分别担任正副总指挥，原中原局第一书记则担任新四军政委，政治部主任、参谋长不变还是由原政治部主任和参谋长担任。
而原本准备随杨震调往东北任东北军区参谋长的原副参谋长，经过慎重的考虑，杨震还是建议在新四军高级指挥人员并不充裕的情况之下，在与新的正副总指挥研究后，上报中央并经过中央的批准，还是继续留在新四军工作。
改编命令的下达，新的政委到任，也就意味着杨震这个临时的政委已经完成了历史使命。就在新的整编命令下达的当天下午，在盐城临时机场上，杨震悄无声息的乘坐两架由延安飞抵盐城，为新四军补充药品、弹药以及装备的抗联运输机离开了苏北。
除了叶超与李慧兰，还有从新四军调回延安十余名新四军回学习的干部，以及自己来的时候带的贴身警卫班之外。杨震走的时候，什么都没有带走。他走的是如此的悄无声息，没有与任何人告别。甚至连庆功兼整编大会都没有参加。
北上抵达苏北的皖南部队干部，直到杨震走的第三天，才知道他们的新调来两个多月的政委已经不告而别。杨震悄无声息的走了，就像他当初来一样。想起这两个多月与这位年轻政委相处的日子，很多干部都感慨万千。
当飞机穿上云霄的时候，原本归心似箭的杨震看着下面的河流、平原，回想起在皖南的这段时光，心里却是同样的相当感慨。虽然时间不长，但毕竟曾经在一起战斗、生活了一段时间。
从苏北到延安的航程比皖南近的多，加上前次私下给杨震飞机加油的一战区长官被调回重庆，在洛阳落地加油已经不可能。所以杨震这次没有在洛阳落地加油，而是从盐城直飞陕北。
不过为了安全起见，大部分的航线还是选在了国统区，避开了敌占区。眼下的日军虽然没有雷达，但日军的反应能力还是相当出色的。不过好在眼下日军驻华海军航空兵主力已经陆续调走，陆军航空兵主力又集中兵力对大后方进行空袭。