小智：
刺刺耳皮丘：小智的初始神奇宝贝，是由大木博士给的蛋里孵出来的，特性是避雷针，左耳上有三个刺刺，不可以进化，可以学会许多普通皮丘无法学会的技能，小智一直携带的神奇宝贝。
迷你龙——哈克龙：野生原野区收服，后来打败水晶大岩蛇而进化为哈克龙。
河马王：巨大神奇宝贝之岛收服，后来通过携带王者之证通信进化为河马王，智慧较高，能举一反三，学习力较强。
伊布——月精灵：彩虹市游戏厅兑换而来，在化石盔之岛沐浴在红色的月亮之下而进化。
伊布——太阳精灵：彩虹市游戏厅兑换而来，在神奇宝贝豪华游轮打败火箭队而进化。
蛋——好运蛋——吉利蛋：彩虹市游戏厅兑换而来的蛋，在奈普鲁岛小智与小霞确立关系的夜晚孵化为好运蛋，是幸福的见证，在大神奇宝贝之岛携带圆石打败火箭队进化为吉利蛋。
大嘴雀：真新镇外的森林收服，是烈雀群的老大，刚刚进化而来。
超梦：自己归来，愿意跟随小智，一直呆在小智身边。
走路草——臭臭花——美丽花：是在内木博士那里收服而来，后对大鲤鱼王使用了睡眠粉后进化为臭臭花，在柚子岛用太阳石进化为美丽花，因为水土原因，颜色鲜艳异常。
乘龙：因暴风雨而走失的乘龙，后来小智舍身救它，从而跟随小智。
水晶大岩蛇：椪柑岛的水晶洞窟中收服，因为长期的变异，地面属性转换为了水属性，不过由于本身是水晶的缘故而非常的怕火，是一个另类的存在。
哥达鸭：哈撒岛收服，本身非常的喜欢漂亮的女生。
大鲤鱼王——大暴鲤龙：搁浅的大鲤鱼王，小智因此收服，后来在小智的指挥下打败了火箭队而进化，是乔伊小姐从小的玩伴。
白海狮：小智在帮乔伊小姐忙的时候，在水中收服的。