但朝廷依旧不知他俩是被误杀，而是误以为阵亡，还让阵亡的明建州左卫军民指挥同知：爱新觉罗·塔克世，长子：爱新觉罗·努尔哈赤，继任大明建州左卫军民指挥使。
而七颗痣之事则被辽东都指挥使司死囚强行烫的伤疤代替，以酷刑来掩盖其真相。
6月初3日远在云南承宣布政使司的明军，大批开赴永昌军民府施甸长官使司姚关县前线镇守，并积极进行防御和作战。
先后在云南承宣布政使司治下的；车里军民宣慰使司思茅县断山、湾甸长官使司、临安府新化州三尖山，一带进行了三次战役，明军均取得了丰厚的胜利，基本打垮了叛军，捍卫了边疆安定。
8月10日大明建州左卫军民指挥使：爱新觉罗·努尔哈赤，以朝廷正三品官职名义继续整顿好兵马，打着朝贡之意入境，前去攻打辽东都指挥使司境内的甲板城。
得到消息的明苏克素浒河部图伦城主：佟佳·布库录（汉名：尼堪外兰）连忙闻风辗转，逃往抚顺守御千户所附近的鹅尔浑城。
使得明建州左卫军民指挥使再度扑空，但却收下图伦女真部数千人而还，致使建州左卫军民指挥使司势力渐增，而图伦女真部势力开始衰弱，再加上图伦城主数次逃离让许多人看到他的懦弱与不可靠！
便纷纷转而投向建州左卫军民指挥使司麾下。
12月初4日，朝廷明兵部尚书：张学颜，上奏说道“南直隶应天府南京城内，中军都督府卫所军队原额有；十二万六千五百一十人，现今只有三万四千二百余人，将近减少了四分之三，宜令南直隶兵部按后湖旧册逐一清查补足。”
明神宗听后准许明兵部尚书之请。
而野心勃勃的明建州左卫军民指挥使：爱新觉罗·努尔哈赤，为了躲避仇人的追杀特意改族姓为（佟）这个姓氏连朝廷与女真各部在内都不知道此事。
毕竟女真族谱里面记载的只是氏，也就是（爱新觉罗氏）并没有姓！所以辽东都指挥使司的档案里面，也只能查到女真各族的氏而已，故此明建州左卫军民指挥使：佟·努尔哈赤，就借助这个名字用朝廷从三品军民卫指挥使名义扩大领土势力。
到了明万历十二年公元1584年4月11日，明腾越州游击将军：刘綖，率领大军至永昌军民府施甸长官使司姚关县一带。
各军乘胜追击，向西直逼陇川宣抚使司，先后斩首敌军万余人，明军进至陇川宣抚使司勐卯。
明腾越州游击将军先分兵占据了陇川宣抚使司沙木笼山，后在亲领大军入城，让原本驻守在陇川宣抚使司伪陇川宣抚使：岳凤，见到四面被围，只得出城投降，其余周边联盟各土司官员，纷纷归附朝廷投降明军。
7月13日负责籍没前任明内阁首辅：张居正，府中财产的官兵们开始登记人口，封锁门户大批人员饿死或者被杀，正当处置年近80多岁明一品诏命夫人：张老太，眼见目睹孙媳们一个个投环求死不得，复用匕首刺目，血流不止，左目遂瞎。
而先前长孙明礼部主事：张敬修，被抓下狱自杀，次孙明翰林院编修：张嗣修，被发配边疆充军（待罪之身）三孙明江陵县状元：张懋修，投井自杀未成功又绝食自尽也失败，一同被发配边疆充军。
四孙明南镇抚司锦衣卫指挥同知：张简修，是武壮士出生又娶了明陕西三边总督兼北直隶刑部尚书与南直隶兵部尚书：王之诰，的女儿因此只是被贬为庶民。
唯有五孙明尚宝司司丞：张允修，听闻风声之后逃到荆州府江陵县老家山林之中隐居起来，以及六孙：张静修，年纪尚幼未授予官职，在亲朋好友帮助下逃到德安府应城县躲过一劫。
就在官兵们动手抓捕明一品诰命夫人：张老太，上奏准备用刑之际明内阁首辅兼文渊阁大学士：申时行、明都察院左副都御史兼刑部尚书：潘季驯，有些于心有不忍，上疏明神宗，认为（治张阁老之狱太急，至于奄奄待毙之老母，茕茕无倚之诸孤，行道之人皆为怜悯）
但是明神宗看后不悦，恰好明都察院江西道监察御史：李植、明都察院河南道监察御史：江东之，等人与明内阁首辅兼文渊阁大学士：申时行、明吏部尚书：杨巍，互相攻击弹劾对方，明刑部尚书：潘季驯，则帮助内阁打压其余弹劾官员。
于是明都察院江西道监察御史就以党庇张居正，「朋党奸逆，诬上欺君」言辞刻薄，呈交给皇帝陛下观看，让明神宗大为喜悦，即刻就令明刑部尚书自辩，谁知明刑部尚书上疏认罪，却被削籍为民。
8月初5日，广西都指挥使司平乐府平乐守御千户所，士兵因军饷分赏不均闹事，杀死打伤了四十余人，并逮捕明平乐县知县：王佩摇，企图索要粮饷。
当地州府命官兵前往讨伐，参加兵变者几乎被杀尽，首要分子明平乐守御副千户：徐凯，被俘不屈自缢身亡。