剩下还有七百多僧侣被判无罪，但是他们也不一定都是真和尚，王瑾亲自出题，对他们进行了一场考核。用王瑾的话说：“要是佛经读得还没有我多，那就别当和尚了。”结果这一考，又刷掉了四百多人，王瑾让这些人全都加入闯军当兵。
还有一些人不愿再出家，也都还俗了，武僧强制当兵，一般僧侣可以自愿选择入伙或回乡务农。
这样一来，全寺只剩下不到三百人了，王瑾便又补充了一批人。之前在云台山，他让伤残士兵冒充道士安身，在这里也可以照此办理。不过王瑾要求，少林寺的纪律要整顿，所有人都要去发、茹素、戒酒，不许火居，因此愿意当和尚的人并不多。
肯出家的闯军士兵，大多是年龄偏大的，有的身体还有伤残。王瑾又下令，新收容的难民中，四十岁以上者可自愿出家，加在一起，寺中僧侣恢复到了六百余人。
住持还是由慧喜担任，执事僧侣全都换成了闯军的退伍兵。功课不得再敷衍了事，每日由慧喜主持学习佛经两个时辰。剩下半日年轻僧人照常习武，年老或有伤残不适合练武的，从事种菜之类的简单生产活动。
寺中的佃户还是原样交租，但租子减至五成。所得租子除了应付寺中必要开支，都作为山寨的军费。由于是灾年，今年的田租免了，如果明年灾情继续，还可以酌情减免。各种劳役全部取消，需要征调佃户干活的时候，按市价支付报酬，长工的待遇也有提高。
王瑾的整顿相当不彻底，按照很多闯军将领的想法，不如干脆把地都分了，让佃农和长工全变成自耕农。
如果是流动作战的时候，他们当然可以一路靠打土豪来补充军需，至于被打掉的土豪的田地，自然是任由本地的穷人瓜分。在这一过程中，也会有很多流氓无赖趁机谋夺土地的情况，但闯军实在是没有余力去管。
而现在，闯军要在山中屯田，并最终转化为本地的统治者。他们需要资金去维持秩序、保护商旅、修建道路。闯军如果只靠自己种地，就做不了这些事情，更不能维持脱产的战斗部队，对抗不了官军甚至土匪，所以还是需要从本地的百姓手中征粮。
他们仍需要少林寺的旗号去糊弄官府，也根本没有能力向自耕农征税，因此最简单高效的办法还是继续沿用已经形成严密规章的原有租佃体系。
王瑾也很无奈，他能略微减轻农民的压力，但是离解放农民还有三百多年的距离。这个世界依然需要地主和佃户，只不过张文朝、白旺负责管理的这个相当于地主的组织是既聪明又有良知的地主。
一个王朝在开创之初，总是会出现一大批地主阶级中的优秀人物。这些人经过了大战乱的筛选，大部分就算没有良知也有理智，知道把长工和佃户压榨得太狠是竭泽而渔的蠢事。就算他们不懂，新建立的，没有各种陈年积弊的官府也会对他们有所限制。
但是随着时间的推移，他们终究会变得和上一个王朝末期的地主毫无分别。就像如今闯军面对的各种敌人一样，一点一点将自己绞死。产生新的统治者，再慢慢堕落，循环往复，如车轮旋转。
王瑾很想打破这个循环，但是他手上没有能摧毁历史车轮的武器。不是三条龙，而是新的生产力。
那将意味着有更多更好的工具、更多更好的食物和商品。意味着产生新的阶级，有了新的利益分配模式。意味着有更多的资金被投入教育，有更多更好的人力资源，也就可以执行更高效的制度。
王瑾非常清楚，自己有生之年做不到这一点。但是，他要为这样的未来创造更多的可能性。