所以孙传庭的思路就是：对于卫所的军屯进行彻底的清查，默认占田的现状，不再直接让卫所兵服役，就把他们当成地主和农民，按照田亩和丁口征收钱粮草料，然后用这些钱粮招募没有足够土地的卫所余丁作为营兵，重新训练成职业雇佣兵。
孙传庭的思路是很正确的，严格来说，清军入关之后废卫所，行绿营，其实就是洪承畴学习了孙传庭的办法再教给他们的。这种政策虽然妨碍了军官、士绅的利益，让他们出钱，但毕竟默认了他们占田是合法的，没有刨他们的根，是一种烈度较低的渐进式改革。目的是为了筹措围剿各路反王的军费，也预防兵变，以免大家同归于尽，符合历朝历代封建王朝改革的一贯思路。用一句这个时代没有的话来说，是符合地主阶级的根本利益的。
然而，这件事由大清的三边总督孟乔芳来办就办得成，由孙传庭来办就办不成。当然不是因为孟乔芳的能力比孙传庭强，而是因为孟乔芳是汉军旗人，一般的汉官拿他一点办法都没有，再加上八旗兵的武力后盾，孟乔芳除了反清义军之外谁都不用怕。那些背叛了李自成的陕西军官、士绅，为了防止闯军打回来找他们算账，也只能和大清一条心。纵然清查军屯之后他们得出一些钱，总比李过、高一功、刘体纯、袁宗第、郝摇旗等人打回来之后拿他们当汉奸处置，均他们的田要强。
而孙传庭只是个空降来的巡抚，带着六万军饷和三千新兵，随便哪个言官都能弹劾他。以他的实力，向这个自己出身的阶层开炮，想从豪强嘴里抠出钱来，就算短时间内能取得成效，也注定是不能长久的，孙传庭这样办事，势必遭人嫉恨，被各路官绅群起而攻之。
相比之下，洪承畴就“聪明”得多，他不是不知道军屯里有很大的问题，可他知道这里面涉及的利益攸关方太多，不是轻易动得了的，因此，他宁肯对此视而不见。他是个“识时务”的人，在自己的能力范围内，会尽可能地努力为自己的主君工作，但凡是可能惹祸上身的事，他一件也不会做。就算这样会导致他效力的王朝灭亡，他也并不在乎，反正不管怎么改朝换代，总得有人去镇压那帮刁民，总有用得着他洪承畴的地方。
当一个阶层集体短视，采用饮鸩止渴的方式疯狂聚敛时，你作为这个阶层的一员，偏偏头脑清醒，甚至还想拉着整个阶层舍弃短期利益，追求长远利益，纵然你打心眼里还是要捍卫本阶层的利益，希望大家生存得更好，你还是会被当成叛徒，好一点的话，也是个狂人。
昔有一国，国有一水，号曰“狂泉”。国人饮此水，无一不狂，唯国君穿井而汲，故无恙。国人既狂，反谓国君之不狂为狂。于是聚谋，共执国君，疗其狂疾。针药莫不毕具。国主不胜其苦，遂至狂泉所酌而饮之。于是君臣大小，其狂若一，国人乃欢然。
既然孙传庭已经做了“狂人”，又不肯像那个国王一样接受治疗，他的下场也就可以预见了。