在一片欢呼声中，李自成回到了衡州。
衡州现在已经成为了整个华南地区的中心。这里位于长沙、赣州、广州、桂林四个省会之间的交通要道上，又有现成的桂王府作为办公地点。再加上这里被闯军占领之后从来没有放弃过，又经过了衡州之战，人心最稳定，因此作为闯军的行政中心是最合适的。
李自成也不是没想过要把根据地放在更稳妥的地方，比如说桂林、梧州、肇庆或者广州。但是他不愿意把根据地放在南岭以南，那样的话，偏安的氛围太过浓厚。
还有一个原因是，岭南地区除了桂林有靖江王府之外，梧、肇、广三城都没有合适的办公地点，李自成又不想新建帅府，所以只能拣有明朝藩王的城市。
广州是目前闯军控制的最大的城市，但是李自成嫌它太过繁华，担心兄弟们进驻广州之后消磨斗志。把王瑾、李过、高一功这仨清心寡欲的圣人放在那里，李自成还比较放心，至于别人，他可就不太信得过了。帅府还是设在衡州这个中型城市比较好，既有足够的规模，又不至于让兄弟们沉湎于享受。而且衡州在湘江之畔，是从两广北伐的必经之路，在衡州建政，也可以表明闯军未来有争夺天下的意向。
闯军的地盘扩张得太过迅速，因此引发的问题也层出不穷。十万大军看起来很多，然而分散到四省之后，各地兵力都显得不足，官吏队伍更是捉襟见肘。在两广和江西的很多地方，根本来不及对投降的官绅胥吏进行仔细甄别，只能除了几个恶名昭彰的之外都一股脑地接收下来，以后再慢慢调查，这无疑会留下非常大的隐患。
在两广，除了一些原有社会秩序被摧毁的受灾地区之外，田兵组织的发展几乎停顿了，因为实在是没有那么多人去组织老百姓。在井冈山一隅之地行之有效的政策，在如此广大的区域推广可就水土不服了。王瑾是田兵制度的“发明”者，但也是他最先提出田兵的推广要缓之又缓。
一税四租的政策还是要推广的，闯军现在政权建设的首要任务是整顿税吏队伍，终止明朝的加派之害。朝廷的征税额度并不要紧，关键是征税过程中官吏和包税人对百姓的侵害。至于地租的额度，没有田兵组织，很难保证是否执行下去。因此闯军暂时先采用“三年不退佃”的方式，三年之内，官府不受理退佃的纠纷。至于三年后怎么样，到时候再说吧。
但是，因为闯军的到来，很多原本就在进行抗租运动的农民，和赣南的农民一样，自发建立了自己的田兵组织。参加者基本上都是原本在宗族中地位低下的人，成为了又一支重要力量。
在政治和经济上，新政权的建立十分艰难，但是在军事上，闯军高歌猛进的速度实在惊人。新年刚过，王瑾和刘宗敏便对两广的残余明军发动了攻击。
岭南的初春对于闯军来说是十分宜人的气候，既没有像北方那样的酷寒，又没有恼人的雨水。这对于闯军的行军、运输和健康来说，都十分有利。
在广西，陈邦傅的军队根本不堪一击。而且刘宗敏只是因过去杀良冒功之罪不许陈邦傅本人投降，又没不许陈邦傅的部下投降。不到一个月的时间，陈部便全部瓦解。陈邦傅本人失踪，不知死活。