“坏人！”梅青娇嗔道，忽然她不知哪来的力气，从刘云怀里挣脱出来，飞一般逃离出去，逃回自己的房间。“砰！”梅青关上门，微微娇喘着，想起刚才的旖旎，心儿仍然怦怦直跳，脸蛋也发烧不止。“臭家伙，下次、下次你突破的时候，打死我也不靠近了！”不过，她内心还是很渴望刘云再突破一次的，似乎那个时刻，他的魅力比平时大了许多，简直就是让人不能自拔!
刘云突破了，此时，他也发现，自己能够操纵原子核之后，重子操控技术立即突飞猛进，以前没能弄懂的东西，如今一切豁然开朗！另外，从变形金刚——威震天那里扫描来的东西，也瞬间消化吸收了，此时，他已经掌握了其中最有用的技术——第二代机械肌肉纤维，以及自动修复装甲。这个自动修复装甲，功能上和纳米自动修复装甲类似，但装甲强度和修复速度不可同日而语。在影片中，变形金刚被人类的导弹、火炮击中后没有任何事，而且，在高强度的攻击下，就算损伤了，也能像变形一般迅速修复，时间只需几秒钟！这里面，自然有他们的灵魂——火种的功劳，但是，他们本身的“骨骼”、“肌肉”和“皮肤”，也就是他们的机体，本身就有这种自动修复功能。如果和以前的纳米自动修复装甲相比，那么，旧的纳米自动修复装甲，原理就像人出血后血液凝结止血一样，这是一个相对缓慢的过程，而变形金刚们的自动修复装甲，就像他们变形一样快！
刘云掌握这两种技术，如果用来制造武器，那么这种武器只要不被一次攻击摧毁主体，就能快速恢复！当然，这种恢复也是需要能量和原料的，虽然原理和形式跟纳米技术不一样了，但没有能量和原料也不行，巧妇难为无米之炊嘛。
至于变形金刚的变形能力，刘云没有扫描到。结构上的变形，相对容易，但变形金刚的变形绝不仅仅这么简单，例如，一辆Camaro汽车，无论如何也没法变成大黄蜂，光是体积上就不可能。变形金刚的变形，更多的是依赖他们的火种，来自火种源的能量，这种能量，使他们身上的机械重构，所以才能发生这么大的改变。注意，他们的重量并没有变化，原因很简单，质量守恒，大黄蜂变成体积小得多的Camaro汽车，重量没有改变，仍是这么重，简单的考虑就知道，这汽车的某些部分密度一定增大了。变形金刚们肯定有各种缩小体积的技术，例如他们能把巨大的火种源魔方，变成人类小男孩能够怀抱的东西，而重量……也变轻了，但火种源本身蕴含的能量极为巨大。根据能量守恒定律，以及质能公式，那火种源本身一定有反重力的东西，除了反重力，还应该有各种力场，在表观上改变“惯性”，不然这么巨大的火种源，质量很大，小男孩怎能抱着它到处跑？
变形金刚核心的技术，刘云并未得到，但他得到的这两种技术，足够使他们的军械发生一场革命了。
突破之后，刘云自己并没有马上应用第二代机械纤维、自动修复装甲这两种技术，而是将这两样东西交给梅青，嗯，让她去开发，把技术变成产品。当然，开发过程中白万松和朱小妍两人也有参与，不过他们水平虽然也很高，但和梅青相比还有差距，更不用和刘云相比了。
刘云这时候在干嘛呢？他在研究重子操控技术，现在他的心神能够操控原子核，这项技术马上就要突破了！
“唔，想不到，利用重子操控技术，能形成丰富多彩的‘异形核’，其中变化，比原子核要多得多！可谓是变化无穷了！”刘云刚刚“组装”出一个由夸克组成的异形核，这个异形核的形状不是球形，而更像一个缩小的纳米机器人。原子核、夸克的尺寸比原子小得多，尺寸上只有原子的十万分之一，体积上更小，只有一千万亿分之一！而今，这样一个小小的异形核，却是一种从未出现过的元素！当然，其实也不是元素，因为它已经不是通常概念上的原子核了。
眼前这个微小的异形核，它有一个非常好的特性，就是有一高一低两个稳定的状态，双稳态，而这两个状态间的能量差，足有1000MeV（兆电子伏）！当然，这个异形核的原子量也很大，九百多原子量，相当于九百多个质子或中子，但在这个核内并不是普通意义上的质子或中子，而是夸克组成的特殊结构。
我们知道，原子核的质量数（大约等于原子量）越高，核本身就越不稳定，越容易衰变。在地球，人们声称已经发现第112号元素，甚至更后面的元素，但这些元素只是在加速器里“一闪即逝”，人们只能捕获其遗留信息而已。高质量数的原子核不稳定，是由其内部的强相互作用决定的。刘云现在根据重子理论，造出这样一个异形的超重核，其结构却能够让其十分稳定，而且还有两个稳定的状态，这是十分奇特的性质。这第一个成熟的异形核，刘云称之为“双稳态高能核”，或者直接称“高能核”，这个概念跟纳米机器人里的“高能能量体”类似，都是用来储存能量的。
刘云仿照纳米机器人的概念，利用重子理论的原理，和重子操控技术，造出一系列的异形核，刘云将其命名为“转换核”、“记忆核”、“催化核”、“转录核”、“装配核”、“分解核”这一系列的异形核。其作用分别为：
转换核：一种能量传递媒介核，能将高能核的能量传递给大量的电子，变成化学能，配合纳米机器人，可以方便而高效地利用高能核里的核能。
记忆核：功能同纳米机器人的记忆体，类似于DNA。
催化核：这是一类异形核，类似酶，功能同纳米机器人的催化体。
转录核：类似RNA。
装配核：同纳米机器人的装配体，类似核糖体。
分解核：同纳米机器人的分解体，可以将异形核或者普通原子核分解成一个个质子、中子，或者夸克组成的其他粒子，如介子。注意通常情况下没有单独存在的单个夸克，这部分内容参看“夸克禁闭”。所谓“夸克禁闭”，简单的说，就是没办法把两个夸克分开，让夸克独立出来。当你花费大力气把两个夸克分开的时候，你所花费的能量超过一定的数值，这时就会再产生一对夸克，此时你得到的不是两个独立的夸克，而是两对夸克分别形成的两个介子。例如，π正介子由一个上夸克和一个反下夸克（“反”是反物质的意思）构成，如果把这两个夸克分开，那么当付出的能量达到一个π正介子的能量之时，就会产生一对新的夸克——反下夸克和上夸克，这时你将得到两个π正介子。
注：所谓“重子理论”和“重子操控技术”是虚构的，但夸克禁闭是夸克理论的内容，不是虚构的。
做出这么多异形核之后，刘云心中一阵舒畅，因为这就意味着，这些异形核可以自我复制了，就跟纳米机器人一样。当然，这些异形核的复制和大部分的行为都需要能量，而且这能量还不小，都是MeV的量级，而这些能量，只能由高能核中来。
由于刘云是参照纳米机器人制造的这些异形核，所以他把这些异形核称为“夸克机器人”，或者“重子机器人”，一般人可能觉得夸克机器人比较容易接受一些。<div>