修炼了一段时间上清仙法后，凌虚转而开始修炼九转玄元功。九转玄元功是凌虚主要修炼的功法，虽然修炼之法极为艰难，而且进度也极为缓慢，但是凌虚每次修炼时都会留有很长的时间来修炼。
灵气不断被凌虚引入体内，在九转玄元功法的运转下，不断的强化凌虚的肉身，如今凌虚已经将九转玄元功修炼到第四转，修炼时不仅要锤炼肉身，还要锤炼元神。
对于如何锤炼元神，凌虚却是有自己的独特之法。因为祭炼紫电惊雷枪，使得凌虚在雷法上的造诣比之寻常修士要强上不少，再加上通天教主传下的上清神雷修炼之法，所以凌虚的施展的雷法威力异常强大，而凌虚锤炼元神之法，就是将元神沐浴在雷海，利用神雷之威来锤炼元神。
由于凌虚利用雷法来修炼玄功，以至于在凌虚闭关的地方不时传来神雷轰鸣之声，使得凌叶不得不出来查看一下凌虚的状态。
凌叶将自己的弟子安顿好后，也自寻地方修炼。如今修炼洞府变得更大，凌叶可选择的地方更多，由于小白泽就在这里睡觉，凌叶为了陪在小白泽身边，所以就将闭关场所选在了天机洞内洞。
发现凌虚只是在利用雷法修炼后，凌叶虽然感觉凌虚修炼之法过于残忍，心中有些担心外，倒也没有打扰凌虚修行，只是出洞安抚了一下被震惊的水灵等门下后，又继续去修炼了。
凌虚一修炼就是数百年，直到凌虚感觉自己招来的神雷无法再锤炼自己的元神后，凌虚才停止了九转玄元功的修炼。经过数百年的修炼，凌虚的九转玄元功虽然未能突破至第五转，但是也到了第四转巅峰，只是缺少一个突破的契机。
修为上达到瓶颈后，凌虚仍未就此出关，而是祭出自己的灵宝开始祭炼起来，使自己可以充分发挥灵宝的威力，同时也使自己对灵宝中自带的法则有更深的领悟。
如今凌虚拥有的先天灵宝有紫电惊雷枪、一气乾坤扇、定海神珠，天机图四件，除了定海神珠无法带出东海被凌虚留在了别府内，其余三件都在凌虚身边。
凌虚先祭起紫电惊雷枪，一边祭炼其中的禁制，一边领悟禁制中的雷道法则。作为凌虚第一件得到的先天灵宝，这些年来多凌虚的帮助还是很大的，无论是道法上的运用，还是法则上的领悟。而且凌虚喜好枪术，所以想尽快将紫电惊雷枪祭炼完全。
只是紫电惊雷枪的品级较高，在修为不足的情况下，凌虚根本做不到将其完全祭炼，所以只能尽自己最大的能力来祭炼。祭炼了紫电惊雷枪后，凌虚又将一气乾坤扇和天机图祭炼了一下，由于这两件灵宝只是辅助修炼，所以凌虚并没有太过投入。
在凌虚感觉到在修炼也无法再提升自己的实力后，凌虚才停了下来，起身离开了天机洞。。
凌虚出了天机洞后，径直来到了药田，施法将药田的范围又扩大了一倍后，凌虚将一气乾坤扇祭出，将游历过程中收集的灵药纷纷取出，种在了药田内，凌虚还将自己偶然得到的一眼灵泉也放置在了药田旁。
接着凌虚又去寻找降龙木的移植场所。在挖出降龙木后，又在其下方遇到极寒之水，那时凌虚就意识到降龙木与这极寒之水是伴生的，所以在移植降龙木时凌虚也需要将极寒之水一同放下。