隆五十三年六月，在奖赏完平定了台湾林爽文之乱的领将近三个月后，清廷终于对广东水师抵御外侮，并几乎全部擒杀来犯英军，并俘获数艘英军战舰的军事行动做出了“判决”：
有功！
而且功劳还不小！
乾隆甚至下旨要两广总督孙士毅与广东水师提督和琳进京述职，以便奖励。
不过，朝廷虽然叙了功，在许多人的眼里，这场并所谓不算小的功劳，其中很大的一部分却都是水分。大多数人认为，整件功劳之中的一大半，倒是因为孙士毅等人将那些俘虏中的黑人送到北京城，给大家平白添了一些话题，增加了一些可以涨面子的“事物”，顺便，黑奴的售卖又为国库稍稍添了几块砖瓦。至于军事方面，反倒没几个人看重。甚至于，在和珅这么一个权臣的力挺之下，广东方面在这场战事之中的军事部署仍然被某些人批驳的体无完肤，乃至毫无价值。
不过，这些争论都不放在孙士毅等人的心上。他与和琳一起进京述职，本身就是乾隆恩赏他们的表现，又何必在意太多？那些嘴巴能说的就能打了？还不是犯嫉妒。所以，精心准备了一个由整颗大珍珠雕琢而成的鼻烟壶给乾隆当作礼物之后，便与和琳一起启程出发了。广东的事务就交给了巡抚何贵，甚至就连和琳，也吸取了赵连升的教训，在临走的时候下了令，水师但凡在他述职期间有重要地调度。都要先行问过何贵的意见。
而在这两人走后，何贵也没有闲着，反正一时半会儿也想不到办法应付英国人对度路利之死可能的反应，干脆就不去想，联合起图萨布找了几个澳门的洋商，真的商定了几单黑奴买卖的生意，打定了主意要大赚一笔的模样。
不过，谁也没有想到，就在这看似太平的局面下，又突然发生了一件大事。把大清国刚刚平复下来的神经再一次挑动了起来。
事情是在孙士毅跟和琳两人离开广东之后一个月发生的。乾隆五十三年七月二十七日，驻藏大臣、一等诚勇公庆麟派人飞马将奏折送到京师：廓尔喀（尼泊尔）兵于乾隆五十三年六月派兵东向入寇西藏，占领了拉木、济陇二处，不久又夺取了宗喀，围攻胁噶尔寨等地。而引廓尔喀兵进入西藏地，竟是六世班禅罗布藏巴勒垫伊西的亲弟弟沙玛尔巴。
原来。
六世班禅入京朝觐期间。乾隆帝多次厚赐珍宝财物，京师各王公大臣以及内外蒙古王公也多所施舍。不下数十万两金银，而宝冠、璎珞、念珠、晶玉之钵、镂金之袈裟等珍宝的数量更是不可胜计。六世班禅在京圆寂后。其同父异母兄仲巴呼图克图却将这些东西全部据为己有，既不布施西藏各寺院及唐古特兵（藏兵）。也不给班禅亲弟沙玛尔巴，而借口却是沙玛尔巴系红教喇嘛。这样，沙玛尔巴感到非常气愤。便前往廓尔喀，极言仲巴呼图克图拥有班禅的巨额赀财和奇珍异宝，唆使其出兵劫掠扎什伦布寺。而在此之前，廓尔喀就与西藏有着不小贸易纠纷。以前，廓尔喀与后藏之间的贸易，都是使用廓尔喀所铸银钱，掺有铜铅，成色不纯。后来，廓尔喀改铸新银钱，银的成分增加，便要求西藏人承认一新银钱当二个旧银钱使用，西藏人不同意。在贸易中，一些藏商将廓尔喀人必须购买地食盐搀入沙土，牟取厚利。噶布伦索诺木旺扎勒苛取商人物件，第巴桑干将廓尔喀人地货特任意加税。这一切，都引起了廓尔喀人的不满。再加上如今沙玛尔巴地挑唆，廓尔喀人对西藏发动进攻就成了一种必然。当然，这其中最主要的原因，还是因为廓尔喀国正在迅速发展，军事力量相当强大，执政者力图对外扩展。
廓尔喀兵进入西藏之后，到处烧杀抢掠，对西藏做出了极大地破坏。乾隆得报之后，为安定边疆，派理藩院侍郎巴忠、成都将军鄂辉带兵进藏援助。巴忠与鄂辉在两月之后率军进入拉萨。不久，两人便向北京递交了奏折，声称已经将廓尔喀人击退，收复全部失地。乾隆大喜，认为二人大涨了天朝威风，下旨重赏。可就在圣旨下达之后不久，吏部尚书刘墉突然呈上了一封匿名信，信上说，巴忠等人贪功邀赏，又心怯畏战，根本就没有与廓尔喀人交战，而是不顾等西藏权贵的反对，私自向廓尔喀人许下了每年元宝一千锭地赔偿，为期三年，以此换取了廓尔喀人的退兵。此举不仅没有大涨所谓的天朝威风，反而让西藏众人对朝廷失望，还助长了廓尔喀人地野心。乾隆得知这一消息之后，勃然大怒，一面命人严查消息来源，同时命陕甘总督福康安麾下大将海兰察为钦差，入藏接替巴忠等人，并查清真象。
而就在西藏事件越演越烈的时候，大清国的南方，安南西山朝正式建立。西山阮氏三兄弟中的老大阮岳废掉了黎朝皇帝黎维祁，自称皇帝，又封其二弟阮惠为北平王，三弟阮侣为东定王，定都归仁府。可是，西山朝刚刚建立没多久，阮氏三兄弟便之间的矛盾就变得尖锐起来。先是北平王阮惠发布檄文，将阮岳所做过的恶事都公布了出来，对此，阮岳大怒，纠集兵马准备北上攻打阮惠。而阮惠自恃势大，便先发制人，率大军直趋阮岳所居的归仁府，连战连捷。阮岳见己方难以对敌，便坚壁清野，节节抵抗。只是，阮氏兄弟没有想到，就在他们自相残杀的时候，安南北方，阮惠的地盘儿上，原北方郑氏部将阮有整突然起兵发难造反，趁着阮惠在南方不能脱身的时机，几乎将北
占领。又重新将黎维祁这“末代皇帝”给扶植了起阮有整终究不得人心，阮惠将阮岳击退至归仁城，便暂时与兄弟和解，之后回军北上，没有多久，便将其击败。阮有整被杀。但是，让阮惠没有想到的是，阮有整扶植起来地黎维祁却逃到了大清国的境内。并且通过广西巡抚向乾隆上书，请求清廷出兵助黎氏复国。
乾隆五十三年十一月。刚刚回到广州没有多久的两广总督孙士毅就接到了乾隆命其率领两广军队进军安南的命令以及一颗刚刚铸成没有多久的“大清皇帝御敕：安南国王”的大印。