刘备倒是很识时务，他是第一个写信赞成取消州牧制，带头承认马宁的长安朝廷的统治地位。
和刘备一样表态支持取消州牧制的大有人在，比如和益州牧刘焉势同水火的汉中太守张鲁，兄弟几人把持交州各郡的南越世家交趾太守士燮等人。
而更多的诸侯，尤其是那些已经自称州牧的，比如袁绍，袁术，刘焉，公孙瓒之流都是拒不表态支持，也不派使者赴长安觐见，更遑论向献帝进贡了，俨然已经是开始军阀割据的架势了。
马宁对所有表示善意的都予以积极的回应，不久，长安朝廷颁布了诏书，任命陶谦为徐州刺史，领左将军。
曹操为兖州刺史，领右将军；刘表为荆州刺史，领后将军；马腾为凉州刺史，领前将军；徐晃为并州刺史，领卫将军。
徐荣为度辽将军，李傕为京兆尹，郭汜为左冯翎，樊稠为右扶风，刘备为豫州刺史，士燮为交州刺史，张鲁为益州刺史。
当然这些刺史的任命有些是需要自己去争取地盘的，朝廷只是给了一个大义的名分，至于那些没有积极回应的人，马宁可不会顾及他们的想法。
不管关东诸侯都有什么不同的想法，最起码现在没有人能从军事层面上威胁到马宁，马宁充分的利用了他们彼此之间的关系互为牵制，所以马宁可以放心大胆地在长安大展拳脚了。
首先就是让饱受战乱之苦的关中三辅和荒无人烟的河南恢复生产和人口，贾诩将并凉地区实行多年的屯田制度照搬过来，开始进行大规模的屯田，这些地区的土地都很肥沃，只是缺少开发而已。
其次，马宁大力鼓励工商业的发展，加强关中、西域和关东地区的贸易往来，尤其是鼓励关中地区的财阀和贵族加入边境贸易之中，要知道董卓将洛阳的富户可都迁到了长安，长安已经成为整个大汉富户最集中的城市了。
第三，马宁在自己的控制区域兴修水利，改良道路，这些工程都需要大量的劳力，其中很大一部分由匈奴仆从军抓来的奴隶来承担，剩下不足的劳动力，则由地方政府征召民夫来补充。
并凉和关中地区相对比关东各地，还算战乱较少，灾荒较轻的地区，有不少关东流民从关东各州郡迁徙而来，除了去屯田的，还有不少富余的劳动力正好参加这些基础工程建设。
最后也是最重要的，就是马宁对大汉护国军的重新整编，无论是军服制式，还是部队编制，马宁都进行了修整，在护国军中早已成熟的书记官制度也被马宁推广开来。
部队编制方面，在原来的团一级编制之上，增加了师一级编制，这是周朝之时就有的编制，毕竟护国军现在的规模扩大了很多，二三十万大军，如果还是以团为最高编制，就不利于指挥作战了。
师一级编制的长官暂以中郎将为职衔，团一级编制的长官为校尉，营一级编制的长官为都尉，以此类推。每一个师编制五个团，每个团编制五个营。
除了护国军之外，长安城还有一支单独的中央禁军，这支中央禁军一直掌握在宦官手中，规模不大，只有两千人，现在马宁也将它收编，交由李肃管理。
原先并凉二州以及司隶校尉部各郡国的郡国兵，则统一改编为城卫军，继续负责各地的治安，除此之外，边塞各郡县开始成立新的边防军，以代替以前的军户制度。
当然老军户如果不愿意种田放牧，也可以参加新的边防军，不过不再是世袭制度，而是募兵制，由朝廷发放俸禄，不事生产，边防军是和护国军一样的常备军性质。