朝下一个目标旅行地小智一行人，途中经过了一个非正道馆，然后小智用皮卡丘搞定了小明的三只宝可梦。并让他楚认识到，他那种折磨宝可梦的方法是行不通的，那种方法只能使用一，之后就没有用了。小明也认识到了自己的不足，毅然决然地关掉了道馆，去旅行了，还对小智说，石英大赛，他也会参加，到那个时候，希望和小智一场。小智也答应了。
一行人在穿过一个不的森里遇到有人欺负，小智替他解围。然后和一个优藤圣代的人进行了一场对战，也让意识到了自己的不足，着他们又踏上了旅行。
经过了一片宝可梦育区，然后因为小霞想要服一只走草，而惹来了一只妙蛙种子，他们跟着来到了一家宝可梦疗养院，遇到了一正在照顾伤宝可梦的少女小翠。
值得一提的是，小翠和小黄因为之前他们曾经一起照顾过宝可梦，所以他们成为了好朋友。
这个时候，火箭队三人组一地登场，说出出场台词后，就皮卡丘的十万伏送上天了。
妙蛙种子起了好胜心，直要挑战小智，然后，皮卡丘过去就是一个瓦割，妙蛙种子失去战斗能力，小智成功服妙蛙种子……
值得一提那只走草也在小黄的劝说下。小霞顺利服
莎莉娜之前已经得到了从小智那里得到了巨沼怪的精灵蛋，并向莎莉娜解释了巨沼怪的事，莎莉娜就决定好好照顾那颗蛋消除巨沼怪的仇之心。
……
在服妙蛙种子之后，小智一行人继续朝枯叶市旅行，此时他们又不道怎么走的，来到了一个山老里。
“啊嘞？前面……”小智突然停住了，因为，前面地岩石上，有着一只小火龙……
“是小火龙啊！在没有得到皮卡丘地时候，我就想着要选择它的……”小智兴奋的说道。
小智来到了小火龙跟前，“小火龙，你在这里干么？你看起来是有主人的，是在等你的主人吗？”小智地语气很温和，没有让小火龙感到一丝危险。
“嗷嗷？嗷嗷……（你，可以听懂我的心声？没错，我的主人让我在这里等他，他说过，会来我的。）”小火龙非天的说道。
“是么？”小智笑着说道。但是心中已经有了猜测，这个小火龙，看来是抛弃了。
“可是你现在身体很虚弱啊！要赶紧疗。”小智对小火龙说道。
“嗷嗷嗷……”小火龙摇了摇头。表示拒绝。
“看来，你很喜欢你的主人啊！罢了，我们无法干涩你的选择。希望你的主人的会来你见吧！对了，这个给你。”小智拿出一个蓝橘，在小火龙跟前，然后站起来离开了。
“可是看这天气似乎马上就要下暴雨了，难道你的忍心这样吗？小智哥哥”因为小黄生在森里所以道很多天气的事。
小智突然停住脚，三秒过后，小智从新转过身，来到了小火龙跟前，“小火龙，我觉得，你还是跟我们一起去山下好了，前面有一家宝可梦中心，说不定能遇见你的主人哦！”
“嗷？嗷嗷嗷！（的？你没有骗我？）”小火龙疑。
“我不会骗你的，而，马上就要下暴雨了，你也不希望你的主人为你担心吧。”小智说道。
小火龙头沉默了片刻，“好吧！我相你。”