在等待皇帝召见的过程中，阎应元的心情颇为激动，向来沉稳厚重的他竟有些坐立难安。过了片刻，听到内侍传呼，心顿时剧烈跳动起来，面红耳赤，他深深地吸了口气，极力控制住忐忑的心情，嘱咐自己见到天子时千万不能失态。对于自己首被皇帝召见，他既感到不胜宠荣，又不免提心吊胆。
他躬着腰缓步登上台阶，走进殿内，虽然先前已经有所预料，但真的进了威严肃穆的乾清宫，出身于微寒的他仍然感到一股巨大的威压向他罩来，让他不敢抬头。
迈出几小步后，几乎是一进大殿，就对着正殿位置大声禀报：“臣侍卫亲军参将阎应元，叩见吾皇万岁！”说完赶快跪下行礼。
自阎应元进殿后，朱由渠就下意识的开始打量起他来，见阎应元身材高大，蜂猿臂腰，一副标准的武人身形，心里对他已有几分欢喜，加上看到阎应元行礼时极为虔诚，更使朱由渠感到十分满意。
不过他早已决定要用“恩威兼施”的办法来驾驭像阎应元这样突然超拔的能吏，避免他们骄狂自大，所以对他行的大礼并不谦让，等阎应元恭恭敬敬的行完礼后，方才用略带亲切的口气叫起身。
打量完阎应元后，朱由渠微笑着说：“阎卿果然英武不凡。朕听闻阎卿任职江阴典史年余间，打击水寇匪盗颇为得力，屡有斩获，令宵小不堪窥视，江阴绅民交相传颂阎卿之德，可有此事？”
阎应元诚惶诚恐的道：“微臣平日只是愚心任事，不敢躲避艰难，只求做好份内之事，不辜负圣恩。”
朱由渠点了点头，脸露赞许之色：“今虏、寇猖镢，社稷倾危，满朝上下若都如你这般专心任事，何愁皇明不能中兴？”
“微臣惶恐，愿为吾皇效力，万死不辞。”
“卿不辞辛劳，勤于王事，忠心可嘉，朕心甚为喜慰。从即日起，卿便是朕的亲军参将了，望卿不负朕望，为大明尽忠尽责。”
“微臣叩谢皇恩。”
……
觐见完毕，出了皇宫后，阎应元心中依旧心绪难平，天子亲自召见，温声勉力，足见对他的重视和亲近，这一切都使他感到高兴也有一丝丝的惶恐不安。他决心鞠躬尽瘁，死而后已，以求不负皇帝的超拔之恩。